养猪场每天都会产生很多猪的排泄物。对生物而言，从食物中摄取养分、再将残渣排泄为粪便，是理所当然的事情。而问题在于，我们应如何处理这些排泄物。要作为废弃物处理？还是作为资源重新利用？无论哪一种，都必须花费相当的费用。
馆森方舟牧场从一开始就不断摸索循环型农业。所谓循环型农业，就是把畜产或农业、家庭等排出的废弃物作为肥料等使用。把农业排出的垃圾循环再利用是建立可持续发展型农业的重要措施。
我们收集养猪场的排泄物，以及来自餐厅、火腿工房的厨余垃圾，制作成了完熟型堆肥。这种肥料不仅已使用在牧场的田地中，也深得附近农家的喜爱。
收成的小麦和蔬菜等用于制作牧场餐厅的菜品，如猪肉包、面包和甜点等。我们也可以通过直营商店及邮购的方式，送交到想购买的顾客手中。通过这些方式，以打造可持续发展型农业为目标的牧场，顺利实现了资源的有效利用。

馆森方舟牧场的土地，是在上世纪80年代，基于国营农地开发计划，通过砍伐林木开垦出来的。但当时一直找不到合适的土地管理者。我们遇上这块土地，正是在那个时候。牧场的创始人秉承“让日本的农业强势复苏，并作为有梦想的产业交给下一代”的理念，将这片方圆100公顷的土地托付给了我们。
但是，这片土地如沙漠般全是黏土质石块、完全不含养分，并不适合种植农作物，面对这样的耕种条件，一开始我们完全不知如何是好。然而，每个事物都有其不同面。后来，我们发现这块土地有一个很大的优点——这是一块完全未使用过农药和化学肥料的土地。我们当即下定决心，难得有一块如此干净的田地，就运用这一优势来做农业吧。我们选择首先从土壤培育开始，使用动物排泄物制作堆肥的有机农业也随之启动。
最初种植的是用来做岩手本地面粉的南部小麦。一边培育土壤，一边慢慢拓展各种香草植物和蔬菜的栽培。如今，我们也依然坚守这一无农药耕作方式。我们的田地里蕴含了大量的活性微生物，这一点也获得了相关检验机构的认定。
无农药栽培需要大量人力，最大的难题就是除杂草。每年夏初，所有工作人员早晨起来的第一项工作，就是给方圆10公顷的小麦田做除草作业。有好几次，由于杂草没有完全清除干净，影响了作物的生长，工作人员只能懊悔地把还在生长期的作物全部清理。
相较于一般的栽培方式，无农药栽培的收成很难提高。但当我们联想到顾客们充满喜悦笑容，品尝着餐桌上能放心食用的小麦面包、猪肉包、糕点、乌冬面的情景时，就有了不断努力的坚定信心。

原本绿意盎然的山林因开垦农田而消失，眼前变成了一片荒地。这样的情景，如同大自然被赤裸裸地剥了皮。面对这样的情景，牧场创始人下定决心，要在21世纪前种植21万棵树！如今，牧场里栽植着杜鹃、日本玉兰、紫玉兰、樱花、梅、四照花、山茱萸、日本冷杉、枫树、日本吊钟花等各种花木。
除此之外，由薰衣草、玫瑰及香草植物构成的“薰风花园”，开满郁金香和串儿红的“梦见之丘花园”“虹之丘花园”，四季绽放油菜花、向日葵、荞麦花等可爱花卉的“光辉之丘”等，带给参观馆森方舟牧场的人们治愈和感动。